El científico creador del ''Moco Verde'' que hace posible la mutación de las Tortugas ninja ha sido secuestrado, y estas acuden en su rescate.
Banda sonora con las canciones del filme. Entre ellas, Awesome (You Are My Hero) (Ya Kid K), Ninja Rap (Vanilla Ice), Moov! (Tribal House), Creatures Of Habit (Spunkadelic) o Back To School (Fifth Platoon)